Workshop GOBITMAP
26 juin 2019 @ 9 h 00 min - 27 juin 2019 @ 17 h 00 min
Dans le cadre du défi Modélisation du vivant organisé par la Mission pour les Initiatives Transverses et Interdisciplinaires du CNRS, l’équipe COMBI a déposé un projet intitulé « From Global Ocean Systems Ecology to BIogeochemisTry MoleculAr Probes » ou « GOBITMAP ».
Ce projet réunit plus de 20 chercheurs (en majorité du consortium Tara) des laboratoires suivants :
– EMBL (Heidelberg, Germany)
– ICM-CSIC (Barcelona, Spain)
– ETH (Zurich, Switzerland)
– Dalhousie University (Halifax, Canada)
– IBENS (ENS, Paris)
– Genoscope (CEA, France)
– Station Biologique de Roscoff (Sorbonne Université, France)
– Station Biologique de Villefranche-sur-Mer (Sorbonne Université, France).
Ces derniers se réuniront à Nantes, du 26 au 27 juin 2019, sur le site de la FST du LS2N en salles ABC.
Abstract:
Marine microbial communities play crucial ecological and biogeochemical roles on our planet, forming the basis of our food web, sustaining Earth’s biogeochemical cycles in the oceans, and regulating our climate. While High-Throughput Sequencing data are revealing the under-explored diversity and complexity of these dynamic microbial ecosystems, our ability to understand, predict and monitor their structures and functions is limited. GOBITMAP proposes to design new computational models integrating environmental omics data and ecological information for the modelling of marine microbial communities. These models will not only enable to gain a predictive and mechanistic understanding of microbial species interactions and community function, but also allow the design of biogeochemical molecular probes for acquiring a global and dynamic understanding of ecosystem functioning in the global ocean. Ultimately, these omicsbased molecular probes will facilitate the integration of high-resolution biological knowledge into global ocean biogeochemical models.
Résumé :
Les communautés microbiennes marines jouent sur notre planète des rôles écologiques et biogéochimiques cruciaux, formant la base de notre réseau alimentaire, des cycles biogéochimiques des océans et de la régulation de notre climat. Tandis que les données de séquençage à haut débit révèlent la diversité et la complexité de ces écosystèmes microbiens dynamiques, notre capacité à comprendre, prévoir et surveiller leurs structures et leus fonctions sont limitées. GOBITMAP propose de concevoir de nouveaux modèles informatiques intégrant des données omiques et des informations écologiques pour la modélisation des communautés microbiennes marines. Ces modèles permettront non seulement d’améliorer notre compréhension prédictive et mécaniste des interactions entre espèces microbiennes et de leur rôle dans les communautés, mais également de concevoir des sondes moléculaires biogéochimiques pour l’acquisition d’une compréhension globale et dynamique du fonctionnement des écosystèmes océaniques mondiaux. Finalement, ces sondes moléculaires omiques faciliteront l’intégration des connaissances biologiques à haute résolution dans les modèles biogéochimiques océaniques.
