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Publication  de  la  collection  HAL LS2N-COMBI  pour  2022

Nombre de publications retournées : 23

Récapitulatif du nombre de publications de la collection par types
ART_INT
COMM_INT
THESE
AUTRES
11831

Revues internationales avec comité de lecture (ART_INT)

    • [1] A. Régimbeau, M. Budinich, A. Larhlimi, J. Pierella Karlusich, O. Aumont, L. Mémery, C. Bowler, D. Eveillard. Contribution of genome‐scale metabolic modelling to niche theory. In Ecology Letters ; éd. Wiley, 2022, vol. 25, num. 6.
      https://hal.science/hal-03635158v1
    • [2] Y. Combot, V. Salo, G. Chadeuf, M. Hölttä, K. Ven, I. Pulli, S. Ducheix, C. Pecqueur, O. Renoult, B. Lak, S. Li, L. Karhinen, I. Belevich, C. Le May, J. Rieusset, S. Le Lay, M. Croyal, K. Tayeb, H. Vihinen, E. Jokitalo, K. Törnquist, C. Vigouroux, B. Cariou, J. Magré, A. Larhlimi, E. Ikonen, X. Prieur. Seipin localizes at endoplasmic-reticulum-mitochondria contact sites to control mitochondrial calcium import and metabolism in adipocytes. In Cell Reports ; éd. Elsevier Inc, 2022, vol. 38, num. 2.
      https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03534214v1
    • [3] A. Zayed, J. Wainaina, G. Dominguez-Huerta, E. Pelletier, J. Guo, M. Mohssen, F. Tian, A. Pratama, B. Bolduc, O. Zablocki, D. Cronin, L. Solden, E. Delage, A. Alberti, J. Aury, Q. Carradec, C. da Silva, K. Labadie, J. Poulain, H. Ruscheweyh, G. Salazar, E. Shatoff, R. Bundschuh, K. Fredrick, L. Kubatko, S. Chaffron, A. Culley, S. Sunagawa, J. Kuhn, P. Wincker, M. Sullivan. Cryptic and abundant marine viruses at the evolutionary origins of Earth’s RNA virome. In Science ; éd. American Association for the Advancement of Science (AAAS), 2022, vol. 376, num. 6589.
      https://hal.science/hal-03781924v1
    • [4] S. Schroeter, D. Eveillard, S. Chaffron, J. Zoppi, B. Kampe, P. Lohmann, N. Jehmlich, M. von Bergen, C. Sanchez-Arcos, G. Pohnert, M. Taubert, K. Küsel, G. Gleixner. Microbial community functioning during plant litter decomposition. In Scientific Reports ; éd. Nature Publishing Group, 2022, vol. 12, num. 1.
      https://hal.science/hal-03781927v1
    • [5] M. Caracciolo, F. Rigaut-Jalabert, S. Romac, F. Mahé, S. Forsans, J. Gac, L. Arsenieff, M. Manno, S. Chaffron, T. Cariou, M. Hoebeke, Y. Bozec, E. Goberville, F. Le Gall, L. Guilloux, A. Baudoux, C. de Vargas, F. Not, E. Thiébaut, N. Henry, N. Simon. Seasonal dynamics of marine protist communities in tidally mixed coastal waters. In Molecular Ecology ; éd. Wiley, 2022, vol. 31, num. 14.
      https://hal.science/hal-03781932v1
    • [6] G. Dominguez-Huerta, A. Zayed, J. Wainaina, J. Guo, F. Tian, A. Pratama, B. Bolduc, M. Mohssen, O. Zablocki, E. Pelletier, E. Delage, A. Alberti, J. Aury, Q. Carradec, C. da Silva, K. Labadie, J. Poulain, C. Bowler, D. Eveillard, L. Guidi, E. Karsenti, J. Kuhn, H. Ogata, P. Wincker, A. Culley, S. Chaffron, M. Sullivan. Diversity and ecological footprint of Global Ocean RNA viruses. In Science ; éd. American Association for the Advancement of Science (AAAS), 2022, vol. 376, num. 6598.
      https://hal.science/hal-03781935v1
    • [7] B. Churcheward, M. Millet, A. Bihouée, G. Fertin, S. Chaffron. MAGNETO: An Automated Workflow for Genome-Resolved Metagenomics. In mSystems, vol. 7, num. 4. 15-06-2022
      https://hal.science/hal-03781944v1
    • [8] N. Allègre, S. Chauveau, C. Dennis, Y. Renaud, D. Meistermann, L. Estrella, P. Pouchin, M. Cohen-Tannoudji, L. David, C. Chazaud. NANOG initiates epiblast fate through the coordination of pluripotency genes expression. In Nature Communications ; éd. Nature Publishing Group, 2022, vol. 13, num. 1.
      https://pasteur.hal.science/pasteur-03752264v1
    • [9] A. Abreu, E. Bourgois, A. Gristwood, R. Troublé, S. Acinas, P. Bork, E. Boss, C. Bowler, M. Budinich, S. Chaffron, C. de Vargas, T. Delmont, D. Eveillard, L. Guidi, D. Iudicone, S. Kandels, H. Morlon, F. Lombard, R. Pepperkok, J. Karlusich, G. Piganeau, A. Régimbeau, G. Sommeria-Klein, L. Stemmann, M. Sullivan, S. Sunagawa, P. Wincker, O. Zablocki, D. Arendt, J. Bilic, R. Finn, E. Heard, B. Rouse, J. Vamathevan, R. Casotti, I. Cancio, M. Cunliffe, A. Kervella, W. Kooistra, M. Obst, N. Pade, D. Power, I. Santi, T. Tsagaraki, J. Vanaverbeke. Priorities for ocean microbiome research. In Nature Microbiology ; éd. Nature Publishing Group, 2022, vol. 7, num. 7.
      https://hal.science/hal-03781942v1
    • [10] D. Richter, R. Watteaux, T. Vannier, J. Leconte, P. Frémont, G. Reygondeau, N. Maillet, N. Henry, G. Benoit, A. Fernandez-Guerra, S. Suweis, R. Narci, C. Berney, D. Eveillard, F. Gavory, L. Guidi, K. Labadie, E. Mahieu, J. Poulain, S. Romac, S. Roux, C. Dimier, S. Kandels, M. Picheral, S. Searson, S. Pesant, J. Aury, J. Brum, C. Lemaitre, E. Pelletier, P. Bork, S. Sunagawa, L. Karp-Boss, C. Bowler, M. Sullivan, E. Karsenti, M. Mariadassou, I. Probert, P. Peterlongo, P. Wincker, C. de Vargas, M. Ribera d'Alcalà, D. Iudicone, O. Jaillon, T. Delmont. Genomic evidence for global ocean plankton biogeography shaped by large-scale current systems. In eLife ; éd. eLife Sciences Publication, 2022, vol. 11.
      https://inria.hal.science/hal-02399723v2
    • [11] A. Oliveira, A. Alexandrino, G. Jean, G. Fertin, U. Dias, Z. Dias. Approximation algorithms for sorting by k-cuts on signed permutations. In Journal of Combinatorial Optimization ; éd. Springer Verlag, 2022, vol. 45, num. 6.
      https://hal.science/hal-04416193v1

Conférences internationales avec comité de lecture et actes (COMM_INT)

    • [12] E. Benoist, G. Fertin, G. Jean. L'Inférence de Protéines à travers le Modèle Peptide Quantity Assignment. In 23ème congrès annuel de la Société Française de Recherche Opérationnelle et d'Aide à la Décision, février 2022, Villeurbanne - Lyon, France.
      https://hal.science/hal-03595308v1
    • [13] L. Bulteau, G. Fertin, V. Jugé, S. Vialette. Permutation Pattern Matching for Doubly Partially Ordered Patterns. In 33rd Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching, juin 2022, Prague, République tchèque.
      https://hal.science/hal-03624311v1
    • [14] O. Abdou Arbi, A. Siegel, J. Bourdon. Contributions des entrées sur les sorties pour les réseaux métaboliques sur génomes entiers: performances et utilisation pour des études en nutrition humaine. In CARI 2022 - Colloque Africain sur la Recherche en Informatique et en Mathématiques Appliquées, octobre 2022, Yaoundé, Cameroun.
      https://inria.hal.science/hal-03689107v2
    • [15] G. Fertin, O. Fontaine, G. Jean, S. Vialette. The Maximum Zero-Sum Partition Problem. In 25th International Computer Symposium, ICS 2022, décembre 2022, Taoyuan, Taïwan.
      https://hal.science/hal-04293802v1
    • [16] A. Rodrigues Oliveira, A. Oliveira Alexandrino, G. Jean, G. Fertin, U. Dias, Z. Dias. Sorting by k-Cuts on Signed Permutations. In Comparative Genomics 19th International Conference, RECOMB-CG 2022, mai 2022, La Jolla, états-Unis.In Springer Verlag (éds.), . Springer International Publishing, 2022.
      https://hal.science/hal-03959780v1
    • [17] E. Benoist, G. Fertin, G. Jean. The Exact Subset MultiCover Problem. In Theory and Applications of Models of Computation. TAMC 2022, septembre 2022, Tianjin, Chine.In Springer Verlag (éds.), . Springer International Publishing, 2022.
      https://hal.science/hal-03958441v1
    • [18] G. Fertin, G. Jean, A. Labarre. Sorting Genomes by Prefix Double-Cut-and-Joins. In String Processing and Information Retrieval, 29th International Symposium, SPIRE 2022, novembre 2022, Concepcion, Chili.In Springer Verlag (éds.), . Springer International Publishing, 2022.
      https://hal.science/hal-03958465v1
    • [19] A. Oliveira Alexandrino, A. Rodrigues Oliveira, G. Jean, G. Fertin, U. Dias, Z. Dias. Transposition Distance Considering Intergenic Regions for Unbalanced Genomes. In Bioinformatics Research and Applications 18th International Symposium, ISBRA 2022, novembre 2022, Haifa, Israël.In Springer Verlag (éds.), . Springer Nature Switzerland, 2022.
      https://hal.science/hal-03958480v1

Theses et HDR (THESE)

    • [20] A. Lysiak. Développement de méthodes informatiques pour l'évaluation et l'amélioration de l'identification par spectrométrie de masse des peptides modifiés. Thèses : Nantes Université.
      https://theses.hal.science/tel-04088659v2

Autres publications (AUTRES)

    • [23] M. Burel, A. Régimbeau, D. Eveillard, E. Pelletier. PhotoEukStein opens doors to the metabolism of eukaryotic-algae. In ISME18, août 2022, Lausanne, Suisse.
      https://hal.science/hal-04384915v1
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