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Sciences du vivant


SDV
Mieux vivre, vivre plus longtemps et en bonne santé et faire une utilisation raisonnée des ressources biologiques sont deux enjeux très importants pour le 21ème siècle. Ils ont été définis comme prioritaires par le programme Horizon 2020. Ces préoccupations sont centrales dans le thème transverse en sciences du vivant pour lequel le laboratoire souhaite renforcer et étoffer sa visibilité.



Mots-clés : Imagerie médicale traitement de signaux neuronaux analyse de données génomiques modélisation de réseaux biologiques conception d’organes artificiels robotisation des équipements hospitaliers


Responsable : Samuel CHAFFRON  

La particularité principale d’un tel thème est sa grande pluridisciplinarité. Ainsi, il ne se développe que via des collaborations fortes avec des acteurs du monde des sciences du vivant.
Dans le domaine des STIC, les enjeux se trouvent à deux niveaux.
Le premier niveau concerne la donnée biologique : il s'agit d'améliorer les techniques de production/acquisition, de transmission et de stockage des données, de leur analyse et leur interprétation au sein d’un système vivant. Les acteurs du laboratoire sont très bien placés dans ces domaines avec des compétences en gestion de données dans des contextes distribués, dans la mise au point d’algorithmes d’analyse de données génomiques, dans le traitement de données issues d’imagerie, dans la modélisation et l’analyse de systèmes biologiques complexes.
Les applications naturelles de ces résultats concernent par exemple le développement d’une médecine personnalisée, en collaboration avec les acteurs du monde de la santé ou encore l’étude d’environnements écologiques, en collaboration avec des acteurs du secteur de la génomique environnementale. Ceci peut également aboutir à des partenariats avec les industriels fabricants d’instruments de mesure et d’imagerie.
Le second niveau se place dans le contexte de la construction du futur quartier hospitalo-universitaire de Nantes à l’horizon 2025. Dans ce cadre, une automatisation des moyens et une rationalisation de l’organisation de cet hôpital du futur doivent être développés. Le laboratoire, fort de ses compétences en robotique, automatisme et optimisation est en mesure de répondre à ces enjeux. Les atouts du laboratoire reposent sur un environnement local dynamique et propice.
  • Des collaborations durables ont été établies au niveau régional en santé.
  • En imagerie médicale et nucléaire ;
  • En traitement de signaux neuronaux ;
  • En analyse de données génomiques ;
  • En modélisation et analyse de réseaux biologiques ;
  • En automatisation et en conception d’organes artificiels ;
  • En robotisation des équipements hospitaliers ;

Des projets fédérateurs comme les projets GRIOTE (structuration de la Bio-informatique en Pays de la Loire) et SYMETRIC (mise en place d’une plateforme de traitement de données biomédicales), impliquent fortement les équipes du laboratoire.

Des collaborations durables ont également été établies en écologie au niveau régional et interrégional.

Sur ce thème transverse, les équipes du laboratoire jouissent d’ores et déjà d’une reconnaissance au niveau international. En témoignent les nombreuses collaborations qui existent avec des universités prestigieuses comme Melbourne, Princeton, Maryland pour n’en citer que quelques-unes.


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